Durante la audiencia por el juicio de abusos a los derechos humanos contra el ex mandatario Alberto Fujimori (1990-2000), Cubas admitió que el ambiente del Servicio de Inteligencia del Ejército (SIE) donde se reunían para coordinar sus acciones los integrantes del grupo de aniquilamiento estaba bajo su responsabilidad.
Asimismo, que entregó armamento a los agentes que integraban el Colina en agosto de 1991.
No estaba en el país
Sin embargo, Cubas recordó que se enteró de las matanzas de Barrios Altos y La Cantuta, ambas atribuidas al Colina, por los medios de comunicación porque estuvo de viaje fuera del país cuando éstos sucedieron.
Los Colina han sido acusados como los responsables del asesinato de 15 personas en la zona de Barrios Altos en 1991 y de nueve estudiantes y un profesor de la universidad La Cantuta en 1992.
Fujimori es procesado como presunto "autor mediato" por supuestamente haber dado la orden para las ejecuciones, como parte de su política antiterrorista.